聖泉學園一直以來都是醜聞不斷。一天，一名接受特別命令潛入該學校的特警突然在澀谷街頭被炸死。事件的起因是該名特警利用在學校裡廣泛流傳的“Enola Gay”網站調查學生的行蹤。一個星期之前，在這個網站裡出現了一個令人毛骨悚然的倒數計時的視窗......同一時間，本來與母親一起住在紐約的少女（松浦亞彌飾）被強制遣返日本後被帶到了特殊任務機關。由於遣返前少女的母親被美國的FBI組織逮捕了，特殊任務搜查官吉良和俊便向少女提出釋放少女母親為條件，強逼少女成為“特警—麻宮早紀”。少女為了母親決定化身為“麻宮早紀”並潛入聖泉學園對圍繞“Enola Gay”網站的一切事件展開調查…